mencoder -oac mp3lame -lameopts cbr=128 -ovc xvid -xvidencopts bitrate=1200 input.flv -o output.avi
из avi в 3gp
ffmpeg -i input.avi -b 100k -r 15 -s qcif -ar 8000 -ac 1 -ab 12.2k output.3gp
Можно пользоваться обёртками 3gpwiz, qvideoconverter, kmenc15